苹果iPhone 6s使用的 是A9+M9的芯片组合。A9芯片是苹果自家研发的64位架构芯片，采用了14纳米制程技术，拥有双核心设计，CPU最高频率可达1.8GHz。M9协处理器则是一颗随时standby的协处理器，可以在任何时候唤醒，并且耗电量并不大，这意味着用户可以在休眠的时候唤醒Siri，并且进行一些功能的使用。这种芯片组合为iPhone 6s带来了显著的性能提升，其中CPU性能比A8提升了70%，GPU性能提升了90%。