旗舰机电池容量较小的原因主要有以下几点：

外观设计和工艺水平要求更高：

旗舰机通常追求轻薄时尚的设计，这使得手机内部空间受限，无法容纳大容量电池。

处理器性能差异：

旗舰机使用的处理器性能较好，因此相对更省电。即使电池容量较小，也不会对手机的续航产生太大影响。

功能丰富，元器件多：

旗舰机通常搭载更多高级元器件，如多摄像头系统、NFC、红外遥控、石墨烯片、双扬声器等，这些元器件占用了大量内部空间，使得电池容量难以做大。

市场定位和用户需求：

旗舰机主要面向对手机性能和外观设计有较高要求的用户，电池续航并非主要卖点。此外，用户对旗舰机的期望是轻薄便携，因此厂商在设计时会在电池容量和机身厚度之间做出权衡。

成本控制：

旗舰机的成本已经非常高，增加电池容量会进一步提高成本，而这部分成本最终可能会转嫁给消费者。因此，厂商更倾向于在保持性能的同时，通过优化设计和使用高密度电池来平衡续航和成本。

技术和设计趋势：

随着手机技术的进步，轻薄化成为一大趋势。旗舰机为了保持其高端形象和良好的手感，往往会在电池容量上做出妥协。

综上所述，旗舰机电池容量较小主要是受外观设计、处理器性能、功能需求、市场定位、成本控制以及技术和设计趋势等多方面因素的影响。