红米1S移动版比其他两个版本便宜100元的主要原因如下：

使用国产3G技术：

移动版使用我国自用的3G技术，即TD-SCDMA，相比联通版和电信版使用的WCDMA和CDMA2000技术，支付给外国科技公司的专利费较少，因此成本较低。

芯片和整机专利费：

移动版使用的联发科MT6589T处理器虽然性能与其他版本相当，但由于是国产技术，不需要支付高昂的专利费。而联通版和电信版使用的是高通骁龙400处理器，除了芯片本身的专利费外，还需要支付整机的专利费，这增加了成本。

生产成本降低：

随着技术的成熟和生产规模的扩大，移动版的生产成本逐渐降低，这也是其价格相对较低的一个重要原因。

综上所述，红米1S移动版之所以便宜100元，主要是因为其使用国产3G技术，支付专利费较少，并且随着生产成本的降低，价格也随之下降。