iPhone 6S在iOS 9.1上的表现整体较为流畅。根据用户反馈和测试结果，iOS 9.1相较于iOS 9.0.1在iPhone 6S上的速度有所提升，尤其是在动画效果过渡、应用程序文件夹操作、上拉控制中心、下拉搜索和右滑出Spotlight等方面都有明显的改善。此外，程序响应速度也有所提升，相机加载速度加快，第三方输入法弹出也更加迅速。3D Touch功能也得到了优化，触发几率更高。
然而，也有用户反映在升级到iOS 9.1后，充电速度变慢且耗电速度增加。此外，有观点认为，对于iPhone 6和iPhone 6s这类机型，iOS 9.1与iOS 9.0.2在流畅度上的区别不大。
综合考虑，如果你使用的是iPhone 6S，并且对系统流畅度有较高要求，那么升级到iOS 9.1是一个不错的选择。但如果你对电池续航有较高要求，或者对系统稳定性有疑虑，建议先权衡利弊，或者等待后续版本的更新。