三星Note3不能root的原因主要有以下几点：

官方不建议：

三星官网明确表示不建议三星手机用户获取第三方软件的ROOT权限。因为这种软件并不稳定，且可能带来极大的危害，包括手机性能上的缺陷或系统不稳定。

安全风险：

获取ROOT权限后，用户可以访问和修改手机的所有文件，这增加了手机被黑客入侵的风险，对手机安全构成严重威胁。

保修问题：

如果因为获取ROOT权限而导致手机出现故障，服务中心可能会判断为人为原因，从而不予保修。

技术限制：

某些版本的Note3系统可能不支持某些root软件，导致root操作失败。

综上所述，为了保障手机的稳定性和安全性，以及避免失去保修资格，建议用户不要尝试获取三星Note3的ROOT权限。如果确实需要root，可以尝试在官方支持的条件下进行，或者等待技术成熟后再进行操作。